Учредителем Конкурса на присуждение ежегодной Национальной премии за вклад в развитие российского сегмента сети Интернет («ПРЕМИЯ РУНЕТА») выступает Федеральное агентство по печати и массовым коммуникациям (www.fapmc.ru).
Для решения организационных вопросов и обеспечения функционирования всех рабочих органов Конкурса создан Организационный комитет (Оргкомитет) Конкурса, представляющий собой постоянно действующий орган.
Для осуществления текущей деятельности и решения организационных вопросов Оргкомитетом Конкурса созданы Секретариат и Счетная комиссия Конкурса, Попечительский совет и Экспертный совет Конкурса.
Для осуществления экспертной работы в рамках Конкурса, а также для обеспечения компетентности и объективности заключения о соответствии претендентов и номинантов критериям, отбору номинантов и определению лауреатов Конкурса, создан Экспертный совет Конкурса.
Вся работа по подготовке и проведения Конкурса, а также Церемонии вручения Премия Рунета координируется Российской Ассоциацией электронных коммуникацией (РАЭК).